Kostel postavený v letech 1868 až 1870 v pseudogotickém stylu podle projektu Ing. Antonína Schmidta se považuje za jeden z nejhodnotnějších staveb Českých Budějovic. Byl 28. 9. 1870 vysvěcen tehdejším českobudějovickým biskupem Janem Valeriánem Jirsíkem jako  seminární kostel pro potřeby studentů stejnojmenného Gymnázia, které existuje až do dnešní doby, avšak kostel již nevyužívá. Josef Vojtěch Hellich navrhl hlavní oltář a zároveň je i autorem oltářního obrazu sv. Václava. Venkovní fasády jsou členěny plochými hladkými lisenami a pásem štukových kružeb, umístěných pod korunní římsou, závěr kostela je rytmizován hranolovitými opěráky. Lodě i kněžiště osvětlují vysoká hrotitá okna s vitrážovou výplní, pouze nad vstupním portálem je umístěno okno kruhové.